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/ Les bibliothèques

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Ajouter des références

À partir d'EndNote

Attention: Pour les utilisateurs de bases de données dans le domaine de la santé, il est important de télécharger une liste de périodiques appelée « Medical » avant d'ajouter des références dans EndNote

Fichiers de connexion

Le fichier de connexion contient des instructions qui permettent à EndNote de se connecter à plusieurs catalogues de bibliothèques et à certaines bases de données, dont Pubmed et Web of Science (voir le Tableau de suggestions de catalogues déjà présents dans EndNote). D'autres fichiers de connexion présents dans EndNote pourraient ne pas fonctionner. Si c'est le cas, utilisez plutôt l'approche indiquée dans la section À partir de catalogues et bases de données plus bas dans la page.

Important : L'efficacité des fonctions permettant d'interroger une base de données à partir d’EndNote peut être considérablement réduite par rapport à une interrogation directe dans l'interface d'une base de données.

Atrium (livres, périodiques, documents audiovisuels, sauf les articles)

  • Pour importer manuellement la dernière version du fichier de connexion d'Atrium, consultez la page Fichiers de connexion EndNote.
  • Enregistrer le fichier de connexion dans le sous-répertoire Connections d’EndNote : Poste de travail > Disque local (C:) > Program Files > EndNote X[numéro de version] > Connections

Important : Ne pas inclure de signes diacritiques lors de l’interrogation d’Atrium (accents divers et ponctuations comme é è à . , ; : ç ù ).

Faire une recherche à partir d'EndNote/EndNote Online

EndNote

  1. Dans EndNote, passer en mode recherche en cliquant sur Online Search Mode
  2. Choisir le menu Tools > Online Search...
  3. Dans la fenêtre Choose A Connection, positionner le curseur sur le catalogue ou la base de données désiré (ex.: U Montreal, PubMed (NLM)), puis cliquer sur Choose (s’il ne s’y trouve pas, cliquer sur More).
  4. Une fois sélectionné, le nom du catalogue apparaîtra sous Online Search.
  5. Remplir les boîtes de recherche et fixer les paramètres de champs.
  6. Cliquer sur Search.
  7. Pour ajouter les résultats de recherche dans votre base EndNote, sélectionner les références voulues, cliquer sur le bouton droit de la souris et choisir Copy References To
  8. Retourner en mode intégré en cliquant sur Integrated Library & Online Search Mode
  9. La ou les références transférées se trouveront dans le groupe temporaire Copied References et aussi dans le groupe permanent All References
  10. Au besoin, double-cliquer sur une référence pour modifier son contenu. Fermer la référence en cliquant sur le X gris (pas le rouge!) le plus bas dans le coin supérieur droit.

EndNote Online

  1. Aller dans Collect
  2. Choisir l'onglet Online Search
  3. Sélectionner le catalogue souhaité ou la base de données désirée dans le menu déroulant (ex.: U Montreal), puis Connect
  4. Faire votre recherche comme dans EndNote local. Ne pas oublier de copier les résultats que vous souhaitez intégrer dans votre base de références et, au besoin, dans un dossier spécifique.

À partir de catalogues et de bases de données

Il existe deux types d'ajout de références à partir de catalogues/bases de données : l'exportation directe ou l'importation indirecte. Pour plus de détails sur les étapes à suivre, chercher le nom de la base de données dans Procédures d'exportation de références (RIS) par base de données.

Exportation directe

L’exportation directe est rapide et s'effectue normalement selon ces étapes :

  1. Faire une recherche dans un catalogue ou une base de données.
  2. Sélectionner les références.
  3. Choisir l’option Direct Export ou Save to EndNote ou Format RIS (EndNote, etc.) (les indications varient selon le catalogue ou la base de données).
  4. Ouvrir la base de données EndNote dans laquelle les références seront exportées (naviguer dans le répertoire des fichiers si nécessaire).

Importation indirecte

L'importation indirecte implique de sauvegarder d'abord les références dans un fichier de format « .txt » habituellement, puis d'importer manuellement ce fichier dans EndNote.

Cette méthode s'avère utile si la fonction d’exportation directe n’est pas disponible chez un fournisseur, si le module Web Export Helper ne fonctionne pas, si EndNote n’est pas installé sur l’ordinateur à partir duquel on travaille ou si le fichier de références est reçu par courriel.

Dans le catalogue/la base de données :

  1. Faire une recherche.
  2. Sélectionner les références.
  3. Enregistrer le fichier des références sur votre poste en format « .txt »

Dans EndNote :

  1. Ouvrir la base de données EndNote où vous souhaitez importer les références.
  2. Aller dans le menu File > Import
  3. Sélectionner le fichier à importer en cliquant sur Choose File
  4. Dans le menu déroulant Import Options, sélectionner le filtre d’importation correspondant à l'outil consulté.
  5. Cliquer sur Import
  6. Double-cliquer sur quelques références dans EndNote pour vérifier si chaque champ a été transféré au bon endroit (fermer une référence : cliquer sur le X gris du bas au coin supérieur droit).
  7. Nous écrire si vous rencontrez un problème.

Utilisateurs Mac

Si vous utilisez Firefox, le configurer de façon à permettre l'exportation directe. Si vous utilisez Chrome ou Safari, utiliser plutôt l'importation indirecte.

Attention : Si le fichier comprend des références en français, sélectionner Unicode (UTF-8) dans la liste déroulante Text Translation pour que les caractères accentués s’affichent correctement.

Saisir manuellement une référence

Option à utiliser lorsque l'outil de recherche utilisé ne permet pas l'importation de références dans EndNote.

  1. Sélectionner le menu References > New Reference, ou cliquer sur Ctrl+N, ou cliquer sur l'icône +.
  2. Un bordereau de type Journal Article est créé par défaut. Les bordereaux d'autres types de documents sont accessibles par le menu déroulant (flèche à droite de Journal Article).
  3. Remplir les champs du bordereau selon les règles de saisie.
  4. Enregistrer la référence en cliquant sur File > Save ou en tapant les touches CTRL+S du clavier ou en cliquant sur le « X » gris du bas dans le coin supérieur droit pour fermer le bordereau (cliquer sur Yes à la fenêtre de sauvegarde).

Masquer et afficher les champs vides

Une fois l’information saisie dans un bordereau, il est possible de masquer ou afficher les champs vides en cliquant sur Hide Empty Fields ou Show Empty Fields dans le coin supérieur droit du bordereau de saisie.

À partir de PDF avec DOI

Cette méthode s'applique lorsque vous avez déjà des fichiers PDF d'articles avec DOI sauvegardés dans votre ordinateur.

Pour un article à la fois :

  1. Cliquer dans le menu File > Import > File...
  2. Cliquer sur Choose… puis naviguer vers le fichier PDF sur votre poste.
  3. Sous Import option, choisir PDF
  4. Cliquer sur Import
  5. La référence est ajoutée dans EndNote avec le fichier PDF attaché

Pour plusieurs articles sauvegardés dans le même dossier :

  1. Cliquer dans le menu File > Import > Folder...
  2. Cliquer sur Choose… puis naviguer vers le dossier contenant les fichiers PDF sur votre poste.
  3. Sous Import option, choisir PDF
  4. Cliquer sur Import
  5. Les références sont ajoutées dans EndNote avec leurs fichiers PDFs attachés

À partir d'une bibliographie existante

Web of Science – Exporter les références des articles cités par un article spécifique

  1. Effectuer votre recherche
  2. Identifier le titre désiré et cliquer sur le nombre indiqué à droite de « Times Cited: »
  3. Dans le menu déroulant, choisir « Save to EndNote desktop »
  4. Une fenêtre apparaît. Dans « Number of Records », cocher « Records » et inscrire dans les cases 1 to X (X représentant le nombre total de références listées dans la bibliographie).
  5. Dans le menu « Record Content », sélectionner « Full Record ». Cliquer ensuite sur le bouton « Send ».
  6. Si votre navigateur vous demande ce qu'il doit faire du fichier, sélectionner « EndNote » dans la fenêtre « Ouvrir avec ». Cocher aussi la boîte « Toujours effectuer cette action pour ce type de fichier », puis cliquer sur « OK ».

 Étapes optionnelles pour Web of Science:

  1. Il est possible d’optimiser une ou plusieurs références à la fois en y important dans les champs appropriés des informations additionnelles disponibles dans la base de données PubMed. Sélectionnez la ou les références tout juste exportées, puis cliquer avec le bouton droit de la souris et sélectionner Find reference updates...
  2. Noter qu’avec cette méthode seuls les documents de type articles sont mis à jour. Pour mettre à jour les références de documents d’autres types, dans la base de données, cliquer sur le bouton « Obtenir » associé au document. Une fois dans la page de l’Assistant SFX, aller dans la section « Autres options...» et cliquer sur « EndNote » pour exporter la référence. Une fois la référence présente dans EndNote, double-cliquer pour l'éditer manuellement et sélectionner le type de document correspondant, puis compléter les informations manquantes dans les champs appropriés.

Anystyle.io : créer des références pour EndNote à partir d'une bibliographie existante

Si vous avez une bibliographie au format électronique (ex.: fichier Word), vous pouvez suivre ces étapes pour importer automatiquement des références dans EndNote (en passant obligatoirement par le logiciel Zotero en premier). Cette méthode n'étant pas parfaite, vérifiez le résultat final pour chaque référence.

  1. Sélectionner le texte électronique de la bibliographie. Cliquer sur Copier (ou faites Ctrl+C).
  2. Aller sur le site web AnyStyle et coller le texte électronique dans la zone "1. Parse" dans la case intitulée Paste your references here... Cliquer sur Parse  X references, X étant le nombre de références collées.
  3. Dans la zone "2. Edit", affecter les bons types d'information aux références. Pour cela, cliquer sur l'information à changer et cliquer sur Assign Label

    • Exemple: Dans une référence, je remarque que "Londres/New-York" se trouve dans la ligne Book title. Je sélectionne la case "Londres/New-York", je clique sur Assign Label puis je clique sur Location

    Cette étape peut prendre du temps et être fastidieuse.

  4. Dans la zone "3. Save", cliquer sur BibTeX. Un fichier Export.bib est créé.
  5. Ouvrir ce fichier dans le logiciel Zotero.

    • Le logiciel peut être téléchargé gratuitement. Au besoin, consulter notre tutoriel.
    • Dans ce logiciel, aller dans Actions > Importer... Sélectionner le fichier Export.bib. Les références sont importées dans Zotero.
    • Sélectionner les références, cliquer-droit sur Exporter les documents. Choisir ensuite Format : Endnote XML, cocher tout et cliquer sur OK. Un fichier Documents exportés.xml est créé dans un dossier Documents exportés

  6. Ouvrir EndNote. Aller dans File > Import > File. Sélectionner le fichier Documents exportés.xml avec Import Option: EndNote Generated XML, Duplicates: Import All et Text Translation: Unicode (UTF-8)
  7. Vérifier les références importées dans EndNote (champs Authors, Reference Types, Title, Volume, Issue, etc). Dans le cas d'articles scientifiques, il est possible d’optimiser une ou plusieurs références à la fois en y important dans les champs appropriés des informations additionnelles disponibles dans la base de données PubMed, par exemple. Pour ce faire, sélectionnez la ou les références tout juste exportées, puis cliquer avec le bouton droit de la souris et choisissez Find reference updates...

Transférer des références

Transférer entre son compte EndNote Online et son EndNote local (ordinateur)

Attention ! Nous avons eu des cas rapportés d'effacement irréversible de données parce qu'elles avaient été effacées dans EndNote Online et ensuite, par synchronisation, effacées dans EndNote local). La synchonisation est donc à manier avec précaution.

Dans votre logiciel EndNote local (sur votre ordinateur) :

  1. Cliquer sur Edit puis Preferences puis Sync
  2. Cliquer sur Enable Sync en vous créant un compte en ligne et en inscrivant votre courriel et mot de passe
  3. Cliquer sur OK
  4. Une option nommée Sync Status... apparaît sous All References
  5. Cliquer sur le bouton Sync Library quand vous voulez synchroniser votre base EndNote locale et celle sur EndNote Online.

Transférer de Zotero vers EndNote

Il est possible de transférer des références entre EndNote et Zotero en utilisant un filtre d'importation. Deux méthodes sont présentées ci-dessous selon que des fichiers PDF soient associés ou non aux références dans Zotero.

1. Sans fichier PDF joint aux références dans Zotero

Dans Zotero :

  1. Clic droit sur Ma bibliothèque ou sur le titre d'une collection (groupe), puis sélectionner dans le menu Exporter la bibliothèque ou Exporter la collection
  2. Sélectionner le format RIS
  3. Enregistrer le fichier sur votre ordinateur.

Dans EndNote :

  1. Choisir File > Import
  2. Cliquer sur Choose file... et sélectionner le fichier à importer.
  3. Choisir le filtre d'importation Reference Manager (RIS)
  4. Sélectionner Import All dans la boîte Duplicates
  5. Choisir No Translation si vous avez des références en anglais uniquement et Unicode (UTF-8) si vous avez des références contenant des accents dans leur texte.
  6. Cliquer sur Import. Les références s'importeront automatiquement sous All References

2. En présence de fichiers PDF joints aux références dans Zotero

Dans Zotero :

  1. Sélectionner votre bibliothèque Zotero ou le sous-dossier des références que vous voulez exporter vers EndNote.
  2. Choisir Actions > Exporter la bibliothèque
  3. Sélectionner le format EndNote XML, puis cocher les options Exporter les notes et Exportez les fichiers. Cliquer sur OK
  4. Enregistrer le fichier sur votre ordinateur en notant attentivement dans quel dossier.

Dans votre ordinateur :

  1. S’assurer que le logicel EndNote est fermé.
  2. Ouvrir le dossier avec l'extension « .Data » de votre base de données EndNote (par exemple My EndNote Library.Data), puis ouvrir le sous-dossier PDF. Si ce dossier n’existe pas, c’est que vous n’avez pas encore associé de fichiers PDF à des références EndNote. Vous pouvez créer ce dossier PDF de façon manuelle, puis l’ouvrir.
  3. Ouvrir ensuite le fichier créé lors de l’exportation Zotero, puis ouvrir le sous-dossier PDF. Dans ce dossier, il devrait y avoir un sous dossier pour chacune des références Zotero qui contient un fichier PDF. Sélectionner tous les sous-dossiers (CTRL+A sur Windows ou CMD+A sur Mac), puis cliquer sur copier (CTRL+C sur Windows ou CMD+C sur Mac).
  4. Retourner ensuite dans le dossier PDF dans EndNote ouvert plus tôt, puis y coller les sous-dossiers que vous venez de copier.

Dans EndNote :

  1. Choisir File > Import > File
  2. Dans la fenêtre Import File, cliquer sur Choose, sélectionner le fichier à importer, i.e. le fichier xml créé dans Zotero, puis cliquer sur Ouvrir
  3. Sous la rubrique Import Option, choisir EndNote generated XML
  4. Sous la rubrique Duplicates, sélectionner Import All
  5. Sous la rubrique Text Translation, choisir No Translation si vous avez des références en anglais et Unicode (UTF-8) si vous avez des références contenant des accents.
  6. Cliquer sur Import, les références s'importeront automatiquement sous Imported References.

Transférer d'EndNote vers Zotero

Dans EndNote :

  1. Séléctionner les références souhaitées (ou CTRL+A sur Windows pour tout sélectionner)
  2. Choisir File > Export
  3. Inscrire le nom du fichier, au besoin
  4. Choisir Text File dans la boîte Type
  5. Sélectionner Select Another Style… dans la boîte Output Style
  6. Sélectionner RefMan (RIS) Export dans la boîte Output Style
  7. Un fichier texte (.txt) sera créé

Dans Zotero :

  1. Choisir le menu Fichier > Importer
  2. Sélectionner le fichier sur votre ordinateur
  3. Cliquer sur Next

Attention : Le filtre d'importation RIS est celui qui permet de mieux transférer des références entre EndNote et Zotero. Par contre, seuls les champs principaux des références sont transférables. Il est donc possible que certaines informations soient perdues durant le processus.

Transférer de Reference Manager vers EndNote (base de données simple)

Dans Reference Manager :

  • Choisir Menu > References > Export
  • Sélectionner le format RIS
  • Enregistrer le fichier sur votre ordinateur

Dans EndNote :

  • Choisir File > Import
  • Cliquer sur Choose file... et sélectionner le fichier à importer
  • Choisir le filtre d'importation Reference Manager (RIS)
  • Sélectionner Import all dans la boîte Duplicates
  • Choisir No Translation si vous avez des références en anglais et Unicode (UTF-8) si vous avez des références contenant des accents.
  • Cliquer sur Import, les références s'importeront automatiquement sous All References

Transférer de Reference Manager vers EndNote (base de données plus complexe)

Dans le cas d'une base de données de nature plus complexe dans Reference Manager, comprenant par exemple des données maison ou des champs personnalisés, nous vous recommandons plutôt de suivre la méthode préconisée dans le guide  EndNote: Converting a Reference Manager database to EndNote. Vous pourrez ainsi contrôler de façon très précise tout le processus de transfert de données et, si nécessaire, conserver dans EndNote les identificateurs uniques associés à chaque référence de RefMan.

Transférer d'EndNote vers Reference Manager

Dans EndNote :

  • Choisir File > Export
  • Inscrire le nom du fichier
  • Choisir Text File dans la boîte Type
  • Sélectionner RefMan (RIS) Export dans la boîte Output Style

Dans Reference Manager :

  • Choisir Menu > References > Capture
  • Sélectionner dans Text File le fichier sur votre ordinateur
  • Inscrire Endnote Refer dans Definition name
  • Cliquer sur OK

Pour plus d'informations, consultez le guide Convert an EndNote library into a Reference Manager database

Transférer de Procite vers EndNote

Étape 1: dans Procite 5

  1. Télécharger le fichier d'archive RIS-EndNote.zip, puis extraire le fichier style RIS-EndNote.pos dans le dossier Styles de ProCite 5 situé dans C:\Program Files\ProCite5\Styles
  2. Ouvrir la base de données ProCite que l'on veut convertir
  3. Menu Edit > Select All, cocher la case Mark Selected
  4. Menu File > Print Bibliography (ou faites CTRL+P) pour un aperçu de la bibliographie.
  5. Dans la boîte de dialogue Output Style, choisir le style RIS-EndNote

    • S'il n'apparaît pas dans la liste cliquer sur Configure Output Style List...

  6. Cliquer sur le bouton Configure
  7. Cliquer sur l'onglet Fields. Sous Optional Fields :

    • Sélectionner tous les champs et cliquer sur OK > Save
    • Nommer et enregistrer sur le Bureau le fichier au format .txt (Texte seulement / Text Only).

  8. Fermer ProCite

Étape 2: dans EndNote X8 et plus

  1. Créer une nouvelle base de données ou en ouvrir une existante
  2. Cliquer sur File > Import ...
  3. Import Data File : cliquer sur Choose File et sélectionner le fichier « .txt »
  4. Import Option : sélectionner le filtre RefMan RIS.enf

    • s'il n'est pas dans la liste, cliquer sur Other Filters ... et choisir le filtre dans la fenêtre Choose an Import Filter

  5. Cliquer sur Import